Nov 25, 2016 11:57
7 yrs ago
English term

rarefied

English to Russian Medical Genetics ...
For further analysis, each sample was rarefied to an even sequencing depth of 5,000 sequences per sample to adjust for uneven sequencing depth across all samples.

Что такое "rarefied"?

Заранее спасибо.

Proposed translations

1 hr
Selected

подвергали разрежению

глубоко вникнуть на скорую руку, к сожалению, не удалось
если интересуют подробности - вот справочная литература
https://arxiv.org/abs/1310.0424

http://dic.academic.ru/dic.nsf/ecolog/4823/МЕТОД

пример использования - статья на стр. 58
https://tidings.tsu.tula.ru/tidings/pdf/web/file/tsu_izv_nat...

--------------------------------------------------
Note added at 10 hrs (2016-11-25 22:20:33 GMT)
--------------------------------------------------

русскоязычные примеры плохие - не о том, нашел вот еще неплохое описание процедуры на английском
http://www.wernerlab.org/teaching/qiime/overview/e
смысл процедуры разрежения сводится к выравниванию или нормализации образцов по глубине прочтения

--------------------------------------------------
Note added at 1 day3 hrs (2016-11-26 15:39:06 GMT)
--------------------------------------------------

Возможно правильнее будет перевести как
нормализация библиотек/данных секвенирования образцов по глубине прочтения/покрытию


Становится возможным проводить точное сравнение двух и более библиотек генов, даже если они были получены с разного количества клеток и секвенированы с разной глубиной покрытия. Для этого, например, можно в ходе анализа использовать из каждого образца равное число случайно выбранных последовательностей, помеченных разными уникальными молекулярными баркодами. Поскольку каждая прочтенная последовательность с уникальным баркодом соответствует отдельной молекуле ДНК либо кДНК, такая нормализация данных секвенирования позволяет кардинально снизить уровень искажения количественной информации, накопленной в ходе амплификации и секвенирования кДНК-библиотеки.
http://rsmu.ru/fileadmin/rsmu/img/about_rsmu/departments/red...

Нормализация данных RNA-Seq необходима из-за различий в глубине секвенирования, длине генов, отличий между образцами по количеству молекул.
http://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:J_MSPyO...

Ведь нулевые значения в образцах с низким покрытием неправильно трактуются как отсутствие данного гена/таксона, в то время как они могут быть всего лишь результатом недостаточного покрытия. Один из методов - metagenomeSeq [71] - учитывает эту особенность данных, моделируя распределение метагеномного состава как смесь смещенных к нулю (англ. zero-inflated) Гауссовых распределений. При этом предварительная нормализация направлена на избавления от смещенности оценки, связанной с неравномерностью покрытия.
http://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:RdXMVQS...
Something went wrong...
4 KudoZ points awarded for this answer. Comment: "спасибо"
33 mins

разбавлен

разбавлен/разжижен

www.eapatis.com/ruSearch/ms.exeData/EAPO/eapo2006/PDF/00674...
Каждый образец был в конечном итоге разбавлен 1:20 и.

--------------------------------------------------
Note added at 34 mins (2016-11-25 12:31:58 GMT)
--------------------------------------------------

https://patents.google.com/patent/RU2159814C2/ru
Каждый образец был разбавлен до 2 A 280/мл в 10 ммоль/л ...

--------------------------------------------------
Note added at 34 mins (2016-11-25 12:32:30 GMT)
--------------------------------------------------

Можно также сказать "разведен"
Something went wrong...
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search