Yo utilizaría locuciones para explicar los términos, para continuer diría paciente que prosigue o completa un estudio clínico; para interrupter hablaría de un paciente que ha abandonado el estudio clínico y para discontinuer hablaría de un paciente que ha sido retirado prematuramente de un estudio clínico, es decir que no lo ha abandonado voluntariamente.

Diccionario crítico de dudas inglés-español de medicina de Navarro: entrada responder donde se explica el término discontinuer

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Note added at 1 hora (2016-10-05 09:05:22 GMT)
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uno puede abandonar un estudio o un tratamiento y después reiniciarlo de nuevo, de acuerdo si prefieres el término suspender o interrumpir pero segun Navarro el dicontinuer no abandona voluntariamente el estudio clínico sino que se le retira del mismo. Quizás convendría más contexto para saber exactamente qué es lo que ocurre en el caso concreto

El Manual de traducción inglés-español de protocolos de ensayos clínicos de P. Mugúerza (descargable gratuitamente) dice:

DISCONTINUATION: INTERRUPCIÓN, DEJAR DE (ADMINISTRAR O DE RECIBIR)
En nuestro contexto, attrition, discontinuation, dropout y withdrawal pueden ser sinónimos, salvo que se les atribuyan matices diferenciadores en un protocolo determinado. (Véase discontinue, to.)

DISCONTINUE, TO: INTERRUMPIR, DEJAR DE (ADMINISTRAR O DE RECIBIR)
Hemos observado que algunos redactores pretenden dotar a este tipo de «detención» de un carácter provisional, transitorio o no definitivo, en oposición a otras finalizaciones del estudio como termination o end of study. Sin embargo, hemos de alertar una vez más sobre cómo actuar aquí: el traductor deberá considerar en su conjunto los diversos términos que el redactor utilice para denotar el final de los periodos del protocolo, y adjudicar a cada uno la traducción que estime oportuna, con la ayuda de este manual. Lo más importante, como hemos señalado varias veces, es la coherencia interna del documento, y que discontinue, por ejemplo, se traduzca siempre igual en nuestro texto, si es posible. Obsérvese que hemos añadido una expresión que, en nuestra experiencia, resulta especialmente útil en muchas ocasiones: «dejar de (administrar o de recibir)».

Por otro lado, el Libro Rojo de Navarro:

discontinue, to. Recomiendo precaución con la traducción acrítica de to discontinue por ‘descontinuar’, pues en la mayor parte de los casos es preferible recurrir a otras posibilidades, como suspender, retirar, interrumpir o abandonar. (...)
►► Obsérvese que en inglés suelen distinguir claramente, en relación con los tratamientos, entre to discontinue (suspender un tratamiento de forma definitiva) y to suspend (suspender un tratamiento de forma pasajera). En español, en cambio, tanto ‘suspender’ como ‘interrumpir’ (y, en menor medida, ‘retirar’, que suele usarse para retiradas definitivas) pueden usarse para indicar una suspensión pasajera o definitiva. De ahí que en la mayor parte de los casos nos veamos obligados a precisar si se trata de «suspensión definitiva», «interrumpir de forma pasajera», etcétera.

La RAE considera discontinuar y descontinuar como sinónimo de interrumpir. Citando el material del curso que imparte el mismo P. Mugüerza:

discontinue, to: interrumpir, dejar de (administrar o de recibir)
Puede que en el entorno lingüístico del traductor se haya impuesto esta otra traducción admitida por las academias y, por tanto, perfectamente correcta: «descontinuar» o «discontinuar». La RAE prefiere la segunda, «discontinuar»; de la definición que da «1. tr. Romper o interrumpir la continuación de algo» se deduce que es un verbo transitivo que no puede aplicarse a las personas (entonces tendría que decir «… la continuación de algo o de alguien»).

Es decir, no hay una diferencia establecida entre "interrumpir" y "discontinuar" y, por tanto, creo que usar los dos verbos para intentar diferenciar al segundo grupo del tercero puede resultar ambiguo, aunque el significado se explicite en la definición de los grupos. Noten, además, que tanto Navarro como Mugüerza afirman que, en inglés, discontinue es más temporal que interrupt, mientras que el texto de Claudia los usa al revés, por lo que es posible que hasta en el texto original resulte forzada o poco clara la distinción.

Por otro lado, en el contexto que da Claudia nada sugiere que las interrupciones o el abandono definitivos sean voluntarios o forzados, por lo que no incluiría ese elemento en la traducción. Tampoco está claro que el estudio finalice a los 6 meses (puede ser un control intermedio). Por todo esto y considerando que en un procotolo de ensayo lo más importante es la claridad, creo que la solución mejor es usar una definición más explícita, como sugiere Bet.