Igor Andreev Mar 13, 2016:

Современные методы исследования могут не позволить обнаружить такие комплексные перестройки и локализовать место их расположения.

Я бы на Вашем месте в большей части случаев, где не подразумевается непосредственно "слияние", переводил "breakpoint junction", как место/положение перестройки (дупликации, инверсии, делеции...), поскольку буквально перевести это выражение тяжело: слияние в точке разрыва
особенно учитывая, что при этом, кроме или вместо обычной транслокации, может происходит ряд дополнительных событий

nataliya79 (asker) Mar 13, 2016:

Such type of complexity might evade detection and breakpoint junction determination by currently used methodologies.

Igor Andreev Mar 11, 2016:

в каком контексте?
Обычно junction - это место слияния хромосом (или генов, в более частном случае), которое происходит после их разрыва в результате рекомбинационных событий или репарации повреждений

nataliya79 (asker) Mar 11, 2016:

Уважаемие переводчики, может ли это быть соединительная область/стык субтеломерных сегментных дупликаций?