That usually means that the student missed the first exam and passed when he/she gained a second chance. This practice to give the student a second exam/test opportunity to is very usual in Brazilian private schools.

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Note added at 7 hrs (2015-01-15 00:32:26 GMT)
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Desde 2013 existem novas regras para o estabelecimento das médias
Há 5 situações distintas no novo sistema de avaliação;
A Média parcial igual ou superior a 7,0 Aprovado
B Média parcial igual ou superior a 5,0 e menor que 7,0,
com nota igual ou superior a 3,0 em todas as unidades Aprovado
C Média parcial igual ou superior a 5,0 e menor que 7,0
com nota inferior a 3,0 em pelo menos uma das unidades Reposição
D Média parcial igual ou superior a 3,0 e menor que 5,0 Reposição
E Média parcial inferior a 3,0 Reprovado.
O rendimento final do aluno é calculado pela média aritmética das notas
obtidas na avaliação de reposição e nas unidades cujas notas não foram
substituídas.
· Para ser aprovado após a avaliação de reposição, o aluno deverá alcançar
rendimento final igual ou superior a 7,0 ou média final entre 5,0 e 6,9
com nota na prova de reposição maior ou igual a 3,0.
O aluno do presente histórico estava na situação C ou D o que lhe deu direito a fazer a prova de reposição. Como ele atingiu a média ele consta como "aprovado por reposição"