Святой Дух проявляет себя в наших умах и сердцах как осознание, утешение, наставление и любовь, как способность выстоять, обрести вдохновение и изменить (преобразить) себя.

works through - здесь буквально "работает через", а литературно это выходит "проявляется в", "проявляется как".

intelligence - понятие более расплывчатое, его можно перевести и как "мудрость", "понимание", "осмысление".

А правду сказать, оригинал не очень-то связен, поэтому переводчик должен передать скорее общее направление мысли и религиозного чувства. Иногда перевод такого предложения зависит от целой страницы контекста.